các bác có ai chỉ minh cách sua loi l502 va l1110 trong gausian voi.:24h_052:
Lỗi của bạn là: Error termination via Lnk1e in /programs/g0x/xxx/l1110.exe Error termination via Lnk1e in /programs/g0x/xxx/l502.exe
l502 và l1110 chỉ là tên của hai files trong số các files cần phải dùng khi thực hiện một vòng lặp trong gaussian thôi. Chạy tới đó có lỗi thì nó sẽ báo là: Error termination via Lnk1e in /programs/g0x/l1110.exe Error termination via Lnk1e in /programs/g0x/l502.exe Tất nhiên mỗi file exe làm một nhiệm vụ tính toán khác nhau, nhưng có rất nhiều lỗi có thể xảy ra với cùng một công việc - nhiệm vụ tính toán. Lý do của lỗi trong từng trường hợp thì cũng có ghi phía trên hai câu thông báo này, và tất nhiên là khá đa dạng, tùy trừng trường hợp: công việc, hệ tính toán, máy móc, kỹ thuật (câu lệnh…)… Ví dụ như: Convergence failure – run terminated; Not enough memory in GToLag:…; The SCF is confused… Nếu muốn người khác sửa cho thì phải show lỗi (tốt nhất là copy file output lỗi ném lên đây), cấu hình máy, công việc muốn thực hiện, tình trạng khắc phục hiện tại (đã thử những cách nào chưa, kết quả ra sao…)…
Mình chạy frequency calculation cho hệ 120 atoms với b3lyp method và 6-31g(d) basis set thì bị báo lỗi như sau (hình như là bước solving CPHF không thể hội tụ, 1002.exe). Bạn hoamo và các bạn trên diễn đàn tư vấn giúp mình với
FoFCou: FMM=T IPFlag= 0 FMFlag= 100000 FMFlg1= 8193 NFxFlg= 0 DoJE=F BraDBF=F KetDBF=F FulRan=T. Symmetry not used in FoFCou. FMM levels: 10 Number of levels for PrismC: 9 PrismC: NFx= 2048 NFxT= 13 NFxU= 13. PrismC: NFx= 2048 NFxT= 13 NFxU= 13. PrismC: NFx= 2048 NFxT= 13 NFxU= 13. PrismC: NFx= 2048 NFxT= 13 NFxU= 13. There are 354 degrees of freedom in the 1st order CPHF. 354 vectors were produced by pass 0. AX will form 89 AO Fock derivatives at one time. PrismC: NFx= 2048 NFxT= 13 NFxU= 13. PrismC: NFx= 2048 NFxT= 13 NFxU= 13. PrismC: NFx= 2048 NFxT= 13 NFxU= 13. PrismC: NFx= 2048 NFxT= 13 NFxU= 13. 351 vectors were produced by pass 1. PrismC: NFx= 2048 NFxT= 13 NFxU= 13. PrismC: NFx= 2048 NFxT= 13 NFxU= 13. PrismC: NFx= 2048 NFxT= 13 NFxU= 13. PrismC: NFx= 2048 NFxT= 13 NFxU= 13. 351 vectors were produced by pass 2. PrismC: NFx= 2048 NFxT= 13 NFxU= 13. PrismC: NFx= 2048 NFxT= 13 NFxU= 13. PrismC: NFx= 2048 NFxT= 13 NFxU= 13. PrismC: NFx= 2048 NFxT= 13 NFxU= 13. 351 vectors were produced by pass 3. PrismC: NFx= 2048 NFxT= 13 NFxU= 13. PrismC: NFx= 2048 NFxT= 13 NFxU= 13. PrismC: NFx= 2048 NFxT= 13 NFxU= 13. PrismC: NFx= 2048 NFxT= 13 NFxU= 13. 351 vectors were produced by pass 4. PrismC: NFx= 2048 NFxT= 13 NFxU= 13. PrismC: NFx= 2048 NFxT= 13 NFxU= 13. PrismC: NFx= 2048 NFxT= 13 NFxU= 12. PrismC: NFx= 2048 NFxT= 13 NFxU= 12. 346 vectors were produced by pass 5. PrismC: NFx= 2048 NFxT= 13 NFxU= 13. PrismC: NFx= 2048 NFxT= 13 NFxU= 12. PrismC: NFx= 2048 NFxT= 13 NFxU= 12. PrismC: NFx= 2048 NFxT= 13 NFxU= 12. Internal consistency error detected in FileIO for unit 1 I= 6 J= 0 IFail= 1.
dumping /fiocom/, unit = 1 NFiles = 86 SizExt = 32768 WInBlk = 512 defal = F LstWrd = -1866038272 FType=2 FMxFil=10000
Number 0 0 0 0 0 0 501 502 Base 12380672 11531776 34173952 19315712 12243456-1866074392 303104 310784 End 12948480 11533312 95721984 23561216 12244992-1866038272 304104 332834 End1 12948480 11533312 95721984 23561216 12244992-1866038272 304128 333312 Wr Pntr 12380672 11531776 34173952 19315712 12243456 530522112 303104 310784 Rd Pntr 12380672 11531776 34173952 19315712 12243456 530522112 303104 310784 Length 567808 1536 61548032 4245504 1536 36120 1000 22050
Number 503 507 508 511 514 515 516 517 Base 385536 386560 1149440 964608 6126592 3296768 1174016 11389952 End 386298 556562 1149455 1026737 6834047 6126588 3296381 11529065 End1 386560 557056 1149952 1027072 6834176 6126592 3296768 11529216 Wr Pntr 385536 386560 1149440 964608 6126592 3296768 1174016 11389952 Rd Pntr 385536 386560 1149440 964608 6126592 3296768 1174016 11389952 Length 762 170002 15 62129 707455 2829820 2122365 139113
Number 518 520 521 522 523 524 526 528 Base 9267200 1172480 1135616 12240896 11529216 12948480 15778816 14362624 End 11389565 1172485 1135651 12243274 11531594 14362201 17192537 15070079 End1 11389952 1172992 1136128 12243456 11531776 14362624 17192960 15070208 Wr Pntr 9267200 1172480 1135616 12240896 11529216 12948480 15778816 14362624 Rd Pntr 9267200 1172480 1135616 12240896 11529216 14362201 15778816 14362624 Length 2122365 5 35 2378 2378 1413721 1413721 707455
Number 530 532 534 536 538 545 547 548 Base 11533312 15071232 17192960 17900544 18608128 12250624 12248064 24268800 End 12240767 15778687 17900415 18607999 19315583 12250638 12250442 25682521 End1 12240896 15778816 17900544 18608128 19315712 12251136 12250624 25682944 Wr Pntr 11533312 15071232 17192960 17900544 18608128 12250624 12248064 24268800 Rd Pntr 11533312 15071232 17192960 17900544 18608128 12250624 12248064 24268800 Length 707455 707455 707455 707455 707455 14 2378 1413721
Number 551 552 559 562 563 565 569 570 Base 1134080 1133056 1144320 1027072 15070208 1148928 12246528 557056 End 1134105 1133076 1144321 1132584 15070803 1149120 12246529 767056 End1 1134592 1133568 1144832 1133056 15071232 1149440 12247040 767488 Wr Pntr 1134080 1133056 1144320 1027072 15070208 1148928 12246528 557056 Rd Pntr 1134080 1133056 1144320 1027072 15070208 1148928 12246528 557056 Length 25 20 1 105512 595 192 1 210000
Number 571 575 577 579 580 581 582 583 Base 23561216 768512 1147392 1133568 1142784 1147904 1145344 1144832 End 24268671 964224 1147417 1133627 1143974 1148531 1147128 1144891 End1 24268800 964608 1147904 1134080 1144320 1148928 1147392 1145344 Wr Pntr 23561216 768512 1147392 1133568 1142784 1147904 1145344 1144832 Rd Pntr 23561216 768512 1147392 1133568 1142784 1147904 1145344 1144832 Length 707455 195712 25 59 1190 627 1784 59
Number 584 588 590 598 600 603 605 606 Base 1149952 25682944 98552320 333312 12379136 1172992 1173504 12244992 End 1150654 27805309 348991390 333314 12380203 1172993 1173505 12246182 End1 1150976 27805696 348991488 333824 12380672 1173504 1174016 12246528 Wr Pntr 1149952 25682944 98552320 333312 12379136 1172992 1173504 12244992 Rd Pntr 1149952 25682944 98552320 333312 12379136 1172992 1173504 12244992 Length 702 2122365 250439070 2 1067 1 1 1190
Number 607 619 634 670 674 685 694 695 Base 12247040 1150976 95721984 1136128 767488 6834176 12251136 1168384 End 12247635 1167877 98551812 1142781 768325 8247897 12253514 1172039 End1 12248064 1168384 98552320 1142784 768512 8248320 12253696 1172480 Wr Pntr 12247040 1150976 95721984 1136128 767488 6834176 12251136 1168384 Rd Pntr 12247040 1150976 95721984 1136128 767488 6834176 12251136 1168384 Length 595 16901 2829828 6653 837 1413721 2378 3655
Number 698 742 989 991 992 993 994 995 Base 1134592 8248320 304128 307200 306688 302592 20480 302080 End 1135294 9266951 306628 310481 306693 302692 20510 302090 End1 1135616 9267200 306688 310784 307200 303104 20992 302592 Wr Pntr 1134592 8248320 304128 307200 306688 302592 20480 302080 Rd Pntr 1134592 8248320 304128 307200 306688 302592 20480 302080 Length 702 1018631 2500 3281 5 100 30 10
Number 996 997 998 999 2999 3001 3003 3005 Base 21504 22016 20992 333824 12253696 348991488 439756800 29928448 End 21604 302022 21042 385076 12379012 439756380 530521692 32050813 End1 22016 302080 21504 385536 12379136 439756800 530522112 32051200 Wr Pntr 21504 22016 20992 333824 12253696 348991488 439756800 29928448 Rd Pntr 21504 22016 20992 333824 12253696 439756380 439756800 29928448 Length 100 280006 50 51252 125316 90764892 90764892 2122365
Number 3007 3026 9996 9997 9998 9999 Base 32051200 29220864 1619700816 1075111464 530522112 27805696 End 34173565 29928319-1866074392 1619700816 1075111464 29220606 End1 34173952 29928448-1866074392 1619700816 1075111464 29220864 Wr Pntr 32051200 29220864 1619700816 1614572856 1069983504 27805696 Rd Pntr 32051200 29220864 1619700816 1525859148 1069983504 28513151 Length 2122365 707455 809192088 544589352 544589352 1414910
dumping /fiocom/, unit = 2 NFiles = 8 SizExt = 0 WInBlk = 512 defal = F LstWrd = 4275200 FType=2 FMxFil=10000
Number 0 508 522 536 538 634 670 998 Base 4274314 27133 27198 2859404 3566859 29576 20480 27148 End 4275200 27148 29576 3566859 4274314 2859404 27133 27198 End1 4275200 27148 29576 3566859 4274314 2859404 27133 27198 Wr Pntr 4274314 27133 27198 2859404 3566859 29576 20480 27148 Rd Pntr 4274314 27133 27198 2859404 3566859 29576 20480 27148 Length 886 15 2378 707455 707455 2829828 6653 50
dumping /fiocom/, unit = 3 NFiles = 1 SizExt = 524288 WInBlk = 512 defal = T LstWrd = 66048 FType=2 FMxFil=10000
Number 0 Base 20480 End 66048 End1 66048 Wr Pntr 20480 Rd Pntr 20480 Length 45568 Error termination in NtrErr: NtrErr called from FIOCnC.
Không đủ bộ nhớ để thực hiện được quá trình tính toán.
Hình học bác sử dụng/tính toán khác xa hình học ban đầu có thể sử dụng để tính tần số. Do vậy, máy sẽ lặp đi lặp lại quá trình tối ưu bên cạnh việc gọi FoFCou. Khi nó thực hiện hết vòng lặp cực đại có thể có (maxcyc) mà không thể gọi FoFCou thì nó dừng lại.
Không biết đã tối ưu hình học của hệ đó trước khi tính tần số chưa? Nếu chưa thì bác tôi ưu đi cái đã. Còn nếu bác đã tối ưu rồi, thì hoặc là chạy lại hình học đã tối ưu và thêm câu lệnh Geom=Check Guess=Check, nhớ là không được thay đổi tên file chk; hoặc là thiết kế lại hình học cho tính đối xứng tăng lên và chạy lại cho tới khi hội tụ cả bốn yếu tố (YES). Nếu cả hai trường hợp trên không khả quan thì bác tăng %mem lên tối đa, đồng thời tăng maxcyc lên (ví dụ maxcyc=1000 chẳng hạn :D).
Chúc bác thành công!
Thân!
Chào hoamo!
Mình đã tối ưu hóa rất kĩ trước khi tính frequency (cả 4 chuẩn hội tụ đều YES). %mem mình set 2gb.
còn maxcyc set trong frequency calculation thế nào? bác chỉ giúp mình cụ thể được ko?
Cám ơn nhiều!
Vậy ạ? Nếu thế thì anh có thể lấy hình học của hệ sau khi đã tối ưu và chạy lại với một trong hai câu lệnh như thế này thử:
-
#p b3lyp/6-31g(d) opt freq Geom=Check Guess=Check
-
#p b3lyp/6-31g(d) freq Opt=(restart,maxcyc=1000)
Hệ của anh lớn nên những lỗi liên quan tới hình học, bộ nhớ là bình thường, rất hay thường gặp. Check vài lần là ổn thôi, tôi nghĩ thế.
Chúc may mắn!
Mình đã giải quyết được vấn đề, Tăng Ram như hoamo nói cũng đúng nhưng đồng thời mình giảm criteria cho bước solving CPHF equations. Nếu để default thì Gaussian hiểu là conver=9 (hoặc 10) mình ko rõ, mình giảm conver=5 thì kq ok mặc dù có thể khác conver=9 một tẹo.
Cám ơn bác đã góp ý cho mình!
Hạ conver theo mình nghĩ giống như hạ mức lý thuyết vậy. Người ta thường sử dụng conver và maxcyc thấp trong trường hợp test thử nghiệm thôi. Còn trong thực tế tính toán thì ít ai làm vậy. Nếu bạn hạ conver với hệ này thì những hệ liên quan bạn phải sử dụng một mức conver như vậy.
Lỗi của bạn mình cũng hay gặp, và cách mình dùng để sửa là check lại hình học của hệ cho đến khi nào thỏa mãn hình học dự đoán cho việc chạy freq thì thôi.
Thân!